杭州医学院是有三个校区的。
学校现有临安、滨江、黄龙三个校区和青山湖科创中心,占地754亩,校舍建筑面积39万平方米;拥有直属附属医院1家(浙江省人民医院),非直属附属医院13家。 杭州医学院是由浙江省人民政府举办的全日制公办普通本科高等医学院校，也是浙江省卫生健康委员会唯一一所直属的医学本科高校。学校已有90余年办学历史，2019年与浙江省医学科学院合并组建新杭州医学院，是省内开设基层医疗卫生服务及健康产业相关专业最多的医学院校之一。
学校现有临安、滨江、黄龙三个校区和青山湖科创中心，占地754亩，校舍建筑面积39万平方米;拥有直属附属医院1家(浙江省人民医院)，非直属附属医院13家，校外实践教学基地近两百家;建有临床护理学1个国家临床重点专科，临床医学、基础医学、药学、公共卫生与预防医学4个省级一流学科(B类)，微创外科、生物医药2个浙江省医学重点学科群，病原分子生物学、劳动卫生学、药学等17个厅局级重点学科(支撑学科、创新学科)。
同时还建有8个省级重点实验室(实验动物和安全性评价、医学生物工程疫苗研究开发、药物安全性评价技术研究、胃肠病学、肿瘤分子诊断与个体化治疗、神经精神疾病药物研究、内分泌腺体疾病诊治研究、生物标志物与体外诊断转化)，2个省工程研究中心(消化道肿瘤诊疗与药物研发、新型疫苗)，1个博士后科研工作站。建有国家食药局药物GLP中心、国家甲型肝炎减毒活疫苗毒种保存中心、浙江省血吸虫病防治中心、浙江省实验动物管理办公室等25个基地和平台。
